Цены на пригородные железнодорожные перевозки регулируются ежегодным установлением ценовой ставки тарифа. По этой причине у компании-перевозчика возникают выпадающие доходы, которые компенсируются за счет бюджета республики в объемах, подтверждаемых ежегодно госкомитетом РК по ценам и тарифам. Объем выпадающих доходов, компенсированных республикой в 2012 году, составил 52 млн. 400 тыс. рублей.

В рамках заключенных соглашений с ОАО «РЖД», правительство РК в 2013 году компенсировало выпадающие доходы компании-перевозчику ОАО «Северо-Западная пригородная пассажирская компания» в полном объеме - 64 млн. 419 тыс. рублей. Это позволило сохранить объемы движения пригородных поездов по 13 маршрутам в размере 13 пар при зимнем графике движения поездов и 17 пар при летнем графике движения.

По многочисленным обращениям жителей республики с апреля 2013 года увеличен период движения курсирующего в летнем графике пригородного поезда № 6377/6378 Петрозаводск-Медгора, а с 1 июля 2013 года назначено ежедневное курсирование пригородного поезда № 6601/6602 Кемь-Маленьга. Сохранены льготы для школьников и студентов в размере 50% от стоимости, которые также полностью оплачивает республиканский бюджет. В 2013 году на эти цели было выделено 1 млн. 256 тыс. 246 рублей, на 2014 год предусмотрено 1 млн. 300 тыс. рублей.

ОАО «СЗППК» в целях оптимизации расходов проводит политику по сокращению маршрутов заведомо убыточных направлений пригородных поездов на всей территории Северо-Западного федерального округа. Вместе с тем в ходе заседания Комиссии Заксобрания РК по вопросам развития транспорта, прошедшего в ноябре прошлого года, представители ОЖД заявили, что сокращение движения пригородных поездов в республике в 2014 году не планируется.