Специалисты министерства финансов Карелии и министерства экономического развития РК провели оценку эффективности реализации долгосрочных целевых программ в Карелии за 2009-2010 гг. Результаты этой работы не утешительны: по итогам 2009 года оценки первого ранга - «высокая эффективность» - не получила ни одна программа. Второй ранг – «достаточная эффективность» - получили только три. Остальные 22 программы получили низкий рейтинг.

По итогам 2010 года высшей оценки удостоились лишь две программы - «Развитие кадрового потенциала республики на период 2008-2012 годов» и «Развитие малого и среднего предпринимательства в республике на период до 2014 года». Еще две – «Повышение безопасности дорожного движения в РК на 2006-2011 годы» и «Профилактика правонарушений в РК на 2006-2011 годы» - оценены как "достаточно эффективные". Как отмечают в карельском Минфине, государственные заказчики этих проектов выполнили рекомендации по результатам оценки за 2009 год и внесли необходимые изменения.

Однако, по мнению специалистов, в большинстве своем долгосрочные целевые программы, реализуемые в Карелии, имеют низкую эффективность.