В охотничьих угодьях и на особо охраняемых природных территориях регионального значения республики начался комплексный учет охотничьих животных, ведущих активный образ жизни в зимний период, который носит название "зимний маршрутный учёт". Он позволяет объективно оценить численность охотничьих зверей и птиц, что необходимо для определения лимитов добычи охотничьих ресурсов в предстоящем охотничьем сезоне. Постоянный мониторинг численности позволяет прогнозировать динамику численности охотничьих животных и в соответствии с этим планировать мероприятия по их охране и воспроизводству. Контроль над ним осуществляет управление охотничьего хозяйства Министерства сельского, рыбного и охотничьего хозяйства Карелии.

В 2013 году зимний маршрутный учёт в республике проводится по новой методике, утверждённой приказом Министерства природных ресурсов и экологии РФ. 18 декабря 2012 года в Министерстве сельского, рыбного и охотничьего хозяйства Республики Карелия прошло совещание сотрудников управления охотничьего хозяйства с участием представителей охотпользователей и сотрудников Института биологии КарНЦ РАН по вопросу проведения ЗМУ, на котором были рассмотрены недостатки и ошибки, допущенные при проведении ЗМУ в прошлые годы, а также обсуждены новые требования к проведению ЗМУ. Для получения объективных результатов в 2013 году планируется пройти 11,76 тыс. км маршрутов ЗМУ.

Проведение зимнего маршрутного учёта - это одно из важнейших мероприятий в охотничьем хозяйстве в зимний период, в котором участвуют сотни опытных охотников, егерей и других заинтересованных лиц. Без представления о численности основных охотничьих животных невозможно рациональное ведение охотничьего хозяйства.