Водоснабжение Карелии сегодня почти полностью базируется на использовании поверхностных вод, качество которых часто низкое. Это приводит к необходимости обеззараживания питьевой воды хлором в больших количествах. Во многих поселках вода подается без очистки, а в большинстве населенных пунктов отсутствуют водопроводные сети. В связи с этим, Глава Карелии Сергей Катанандов подписал распоряжение о создании рабочей группы для разработки бюджетной целевой программы «Обеспечение населения Республики Карелия питьевой водой» («Чистая вода») на 2009-2012 годы (до 2020 года). В настоящее время рабочей группой уже подготовлена Концепция программы «Чистая вода». Главная цель ее - улучшение качества питьевой воды, подаваемой населению, в том числе ее очистка и обогащение, охрана и рациональное использование источников питьевого водоснабжения. Также программа направлена на проведение комплексного, поэтапного финансирования мероприятий, связанных со строительством водохранилищ питьевого назначения, на снабжение питьевой водой наиболее важных для жизнедеятельности населения объектов и сохранение водных объектов, а также экосистем, влияющих на процессы воспроизводства питьевой воды. Оценивается программа более чем в 3 миллиарда рублей. Для ее финансирования планируется привлекать средства федерального, республиканского и местных бюджетов, предприятий и организаций, кредитные ресурсы и инвестиции.